A minimal function to create custom calls. Can be used to acquire unimplemented endpoints and/or raw output without any processing. Refer to the API documentation.

gemma_call(call, ..., json = TRUE, header = "")

Arguments

call

Gemma API endpoint.

...

parameters included in the call

json

If TRUE will parse the content as a list

header

headers to pass to add_headers

Value

A list if json = TRUE and an httr response if FALSE

Examples

# get singular value decomposition for the dataset
gemma_call('datasets/{dataset}/svd',dataset = 1)
#> $data
#> $data$bioAssayIds
#> $data$bioAssayIds[[1]]
#> [1] 32
#> 
#> $data$bioAssayIds[[2]]
#> [1] 33
#> 
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#> 
#> $data$bioAssayIds[[4]]
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
#> $data$vmatrix[[19]][[4]]
#> [1] -0.07094
#> 
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#> 
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#> 
#> $data$vmatrix[[20]][[3]]
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
#> 
#> $data$vmatrix[[23]]
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
#> 
#> $data$vmatrix[[26]]
#> $data$vmatrix[[26]][[1]]
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#> 
#> $data$vmatrix[[26]][[2]]
#> [1] -0.2583
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