A minimal function to create custom calls. Can be used to acquire unimplemented endpoints and/or raw output without any processing. Refer to the API documentation.

gemma_call(call, ..., json = TRUE)

Arguments

call

Gemma API endpoint.

...

parameters included in the call

json

If TRUE will parse the content as a list

Value

A list if json = TRUE and an httr response if FALSE

Examples

# get singular value decomposition for the dataset
gemma_call('datasets/{dataset}/svd',dataset = 1)
#> $data
#> $data$bioMaterialIds
#> $data$bioMaterialIds[[1]]
#> [1] 32
#> 
#> $data$bioMaterialIds[[2]]
#> [1] 33
#> 
#> $data$bioMaterialIds[[3]]
#> [1] 27
#> 
#> $data$bioMaterialIds[[4]]
#> [1] 19
#> 
#> $data$bioMaterialIds[[5]]
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#> 
#> $data$bioMaterialIds[[6]]
#> [1] 18
#> 
#> $data$bioMaterialIds[[7]]
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#> 
#> $data$bioMaterialIds[[8]]
#> [1] 11
#> 
#> $data$bioMaterialIds[[9]]
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#> 
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#> [1] 7
#> 
#> $data$bioMaterialIds[[11]]
#> [1] 34
#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
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#> 
#> $data$vmatrix[[28]][[3]]
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#> 
#> $data$vmatrix[[28]][[4]]
#> [1] 0.1452342
#> 
#> $data$vmatrix[[28]][[5]]
#> [1] -0.08187996
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